Malattie rare – Orphadata: il nuovo look della piattaforma per l’accesso ai dati aggregati di Orphanet
Dal 2011 Orphanet offre l’accesso ad un’ampia serie di dati per la ricerca contenuti nel suo database attraverso la piattaforma Orphadata, che questo mese è stata rilanciata con un sito internet completamente rinnovato, di più facile comprensione e navigazione. 
Ora gli utenti possono accedere ai campioni e a definizioni schematiche delle serie di dati liberamente accessibili e anche a campioni gratuiti e serie di dati su richiesta, il tutto direttamente online.
Gli schemi disponibili permettono agli utenti di sfruttare più facilmente le serie di dati fornite online gratuitamente attraverso la licenza Creative Commons. Ora gli utenti possono conoscere, con un rapido sguardo, il numero di diversi tipi di dati contenuti nel database e anche le dimensioni dei file.
Sono disponibili diversi formati di dati (per il momento XML e JSON), aggiornati ogni mese: presto per tutte le serie di dati sarà disponibile un endpoint SPARQL basato su tecnologia Blazegraph. Dal sito è anche possibile accedere al GitHub di Orphadata, per visualizzare le precedenti versioni delle serie di dati e i cambiamenti delle versioni.
Inoltre, la piattaforma permette l’accesso all’Ontologia delle Malattie rare di Orphanet (ORDO) e al Modulo Ontologico HPO-ORDO (HOOM). Tramite la nuova piattaforma Orphadata, gli utenti potranno accedere all’endpoint SPARQL per ORDO e HOOM e anche a Blazegraph Docker, per condurre ricerche locali.
Per qualsiasi richiesta, il team di Orphadata è a vostra disposizione all’indirizzo data.orphanet@inserm.fr.
Fonte: orphaNews Italia
Tratto da: http://italia.orphanews.org/newsletter-it/editorial/nl/id-26-ottobre-2018.html#or_editoriale-29481
